当プログラムは近江八幡市立総合医療センターを基幹施設とし、10の連携施設を含む合計11施設から構成され、すべての施設において泌尿器科指導医が常勤しています。当プログラムの連携施設は滋賀県・和歌山県・京都府下の大都市圏以外の医療圏にある施設および京都府立医科大学と広範囲にあり、その多くは拠点病院として先進医療を含む診療を行い、地域の泌尿器科医療を支えています。しかし、これらの地域においても泌尿器科医の数は十分ではなく、本プログラムの基幹施設と連携施設が地域の泌尿器科診療を守り、維持しています。この中でも日本泌尿器科学会の拠点教育施設を満たす診療拠点病院（京都府立医科大学、京都府立医大附属北部医療センター、長浜市立湖北病院、市立福知山市民病院、綾部市立病院、京都中部総合医療センター、京都山城総合医療センター、独立行政法人国立病院機構舞鶴医療センター、国家公務員共済組合連合会舞鶴共済病院）と教育関連施設として位置づけられる地域中核病院（白浜はまゆう病院）の二つに大別されます。